Il est possible sous Linux d’avoir des problèmes avec les applications dans le launcher sous forme de doublons voire de triplons. Ce soucis se retrouve aussi dans la liste « Ouvrir avec… » (via clique-droit sur un fichier) définissant les logiciels/applications pouvant s’utiliser par défaut avec un type de fichier en particulier.
Par exemple :

Doublons et triplons de programmes
Pour enlever ces entrées, il suffit de faire
gksudo nautilus
Lancer > Saisir l’emplacement (ou CTRL + L)
Coller : /usr/share/applications
Et supprimer tous les doublons ou triplons en en laissant toujours un.
Attention !
Vous êtes à ce moment en super-utilisateur, vérifiez plusieurs fois avant de supprimer quelque chose, ce sera sans retour arrière.
Cette astuce permet aussi d’enlever des entrées obsolètes.